Kapsułki nawozowe Aquaflora caps należy umieścić za pomocą pincety w podłożu w taki sposób aby znajdowały się one możliwie blisko korzeni roślin i nie wystawały z podłoża. Odległość pomiędzy kolejnymi kapsułkami powinna wynosić nie mniej niż 10 cm przy czym należy wziąć pod uwagę, że każda kapsułka nawozi obszar o średnicy około 12 cm. Nie zaleca się jednoczesnego użycia większej ilości kapsułek niż jedna na 15 litrów wody. Częstość stosowania w zależności od ilości roślin i tempa ich wzrostu powinna wynosić od 3 do 8 tygodni. Aquaflora caps poleca się stosować z innymi preparatami z serii Aquaflora jak np. Aquaflora carbo, Aquaflora K i Aquaflora Fe.